Corresponde a la incorporación o eliminación de sustancias de tamaño molecular muy grande o incluso de microorganismos enteros. En estos casos no se puede realizar la incorporación o eliminación de las formas anteriormente mencionadas, de manera que la célula compromete la membrana celular, es decir, la membrana celular organiza una vacuola que incorpora y transporta la sustancia. Cuando este pasaje introduce materia se denomina endocitosis. Si la sustancia es eliminada de la célula se denomina exocitosis.
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